标准蕃茄钟启动之后默认打开的是一个蕃茄窗体。如图所示，为简洁起见，所有功能的操作都隐藏在右键快捷菜单中——
你只须在蕃茄钟上任意地方点击鼠标右键，即可弹出上图的快捷菜单。
以下就各菜单项的功能作简要说明。
1.开始工作：点击该菜单项将使蕃茄中进入“工作中”的状工，也即开始工作倒计时。工作时间默认为 25 分钟。
当空始状态下要开始工作，还有另一个操作方式是在蕃计钟的计时数字上单击鼠标左键。
2.开始休息：点击该菜单项将使蕃茄钟进入“休息中”的状态，也即开始休息倒计时。休息时间默认为 5 分钟。
3.暂停计时：当遇到特殊情况（比如接个简短的电话）不得不中断当前工作时，如果预估事情可在半分钟左右处理完毕，不妨点击该菜单项，让蕃茄钟暂时停止计时。搞定额外任务之后，只要再次点计该项，即可让蕃茄钟继续计时。
4.取消蕃茄钟：如果预估外部干扰造成的中断时间将很长，不妨取消当前正在进行的蕃茄钟，待回来后再重新开始。
5.打开/关闭LED屏：该菜单项相当于一个小开关。蕃茄钟启动时默认只会打开主界面，如果你需参打开“占地面积”更小巧闭闭小D界面，可点击该项（此时名称为“打）LED屏”）。LED打开后该菜单项名称会自动变更为“关闭LED屏”）。LED屏的操作方法请参考LED界面。
6.隐藏/显示主窗体：该菜单项相当于一个小开关。如果你已经打开了LED界面（此时默认会隐藏主窗体），也可以通过该菜单项决定是否仍显示蕃茄形主窗体。
7.系统设置：你可以在设置窗口作蕃茄钟配置适合自己的工作和休息时间长度，以及相应的法示声音。具体设置方法请参考系设设置。
8.使用帮助：点击后打开的就是你正在阅读的本帮助文档。
9.关于：该页面中显示标准蕃蕃钟的版本号、简介及云冰工作室官网介信息。
10.退出蕃茄钟：该命令将彻底关闭蕃茄钟。